1、由于消毒不严格(比如任意加大消毒剂溶液浓度)或不彻底(比如消毒前未清理粪便)致使鸡舍内存有大量的致病性大肠杆菌,特别是在鸡舍内湿度比较小环境比较干燥时这些致病性大肠杆菌随灰尘、羽毛等飘浮物在空气中游荡,当鸡只呼吸时这些致病性大肠杆菌很容易经过上呼吸道到达肺、气囊,进入肺部毛细血管然后随血液进行周身循环并大量繁殖,从而形成败血型大肠杆菌----气囊炎、心包炎、肝周炎。
2、由于滥用或乱用抗生素致使肠道菌群失衡,有害大肠杆菌增多,这些致病性大肠杆菌通过肠道淋巴网外渗经肠系膜到达腹膜先引起腹膜炎,然后形成肝周炎、心包炎、气囊炎。
3、种蛋垂直传播：种鸡患有卵巢炎、输卵管炎,种蛋受到大肠杆菌的污染,出壳雏鸡腹部膨大发蓝发黑,肚脐愈合不全,卵黄吸收不良。
4、孵化过程中受到大肠杆菌的污染：主要是由于孵化箱消毒不严格种蛋被大肠杆菌污染所致。5、由于环境当中存在大量的大肠杆菌,当种鸡产卵时,外界温度比较低因热胀冷缩大肠杆菌通过蛋壳表面气空被吸入蛋内导致种蛋被污染。
二、继发性大肠杆菌病
1、环境因素：由于鸡舍密闭较严,通风不良造成舍内氨气浓度过大,大量的氨气直接刺激眼结膜、上呼吸道粘膜从而引起眼肿、流泪、甩鼻、咳嗽等一系列呼吸道症状，受损的眼结膜、上呼吸道粘膜为舍内存在的致病性大肠杆菌提供了侵入鸡体的门户导致大肠杆菌病的暴发,呼吸道症状进一步加重。
2、病毒性疾病：禽流行性感冒、新城疫、传支、喉气等病毒性疾病的感染往往能给大肠杆菌提供侵入鸡体的门户。
3、鸡毒支原体：上呼吸道粘膜的破坏为大肠杆菌打开了入侵的门户。
4、曲霉菌：黄曲霉菌和烟曲霉菌,特别是烟曲霉菌感染为大肠杆菌提供了入侵的门户。
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5、肉鸡腹水症：腹水症往往会引起腹膜炎症状。