球虫病常在应激反应出现的几天后发生。这些应激反应包括营养失调、习性的改变、运输和气候变化等。剧烈的应激反应除有利于球虫病的发病外，还可促进球虫病的恶化。鸡群如受到马立克氏病感染，机体对球虫免疫会受到干扰而引发球虫病；感染了法氏囊炎病毒的鸡会使球虫病的症状加剧，可致盲肠出血提前，死亡率提高，黄曲霉毒素的存在会使球虫病死亡率提高40％。
四 宿主差异
鸡的品种、年龄、性别不同，对球虫病抵抗力有显著差别。一般而言，幼雏对球虫的易感性较大；公雏对球虫的易感性高于母雏；白鸡的抵抗力比褐色鸡的抵抗力差；品系越纯对球虫的易感染性越强。
五 耐药性
由于抗球虫药的长期使用，以及使用方法不当，球虫很容易对一些药物产生耐药性。任何一种抗球虫药在使用一定时间后，都会引起球虫耐药性甚至形成耐药虫株，并对该药同类或作用机理相同的其他药物产生交叉耐药性，选择合理的用药方法，制订正确的用药方案，可以限度地延长抗球虫药的使用寿命。
六 球虫虫株的种类、数量以及寄生部位
虫株不同，其致病力也不同，感染数量未达到一定程度，其个体不表现出球虫症状，对中等毒力的虫株而言，感染数量过多时，昕产生新的卵囊数却相应减少，称为“相挤效应”，不同虫株有其特定寄生部位，如果寄生部位发生改变，其致病力会下降乃至消失。
七 与其他病原关系
组织损伤和肠道功能的变化可造成各种有害细菌的入侵和繁殖，在鸡体内大肠杆菌和球虫之间有相互作用。研究表明球虫与其他肠道细菌具有协同作用，肠道细菌会起到增强球虫致病力的作用。
