一、营业执照
营业执照是公司注册的必备证明，也是入驻京东自营店的必要证明之一。营业执照是公司合法经营的证明，包括公司名称、注册资本、经营范围、法定代表人等信息。在入驻京东自营店时，需要提供营业执照的复印件。
二、食品流通许可证
水果属于食品类商品，因此入驻京东自营店需要提供食品流通许可证。食品流通许可证是国家食品药品监督管理局颁发的证明企业合法经营食品的证件，证明企业符合食品安全管理的要求。在入驻京东自营店时，需要提供食品流通许可证的复印件。
三、组织机构代码证
组织机构代码证是行政管理部门颁发的证明企业组织机构代码的证件，包括企业的组织机构代码、企业名称、企业类型等信息。在入驻京东自营店时，需要提供组织机构代码证的复印件。
四、税务登记证
税务登记证是国家税务部门颁发的证明企业已经完成税务登记的证件，包括企业名称、纳税人识别号、税务登记证号等信息。在入驻京东自营店时，需要提供税务登记证的复印件。
五、品牌授权书
如果入驻京东自营店的水果品牌不是自己的品牌，需要提供品牌授权书。品牌授权书是品牌方授权给经销商或代理商使用品牌的证明文件，包括品牌方名称、品牌名称、授权期限等信息。在入驻京东自营店时，需要提供品牌授权书的复印件。
六、产品质量检验报告
水果是食品类商品，需要提供产品质量检验报告。产品质量检验报告是对产品进行检验后出具的证明产品质量合格的文件，包括产品名称、检验项目、检验结果等信息。在入驻京东自营店时，需要提供产品质量检验报告的复印件。
七、商标注册证书
如果入驻京东自营店的水果品牌已经注册商标，需要提供商标注册证书。商标注册证书是行政管理部门颁发的证明商标已经注册的证件，包括商标名称、商标注册号、商标注册日期等信息。在入驻京东自营店时，需要提供商标注册证书的复印件。
以上是在京东自营店入驻水果类需要提供的公司注册证明，企业在准备入驻京东自营店时，需要提前准备好这些证明文件，以便顺利入驻。