在商业特许经营备案过程中，常见的问题包括但不限于以下几个方面：
申请材料不完整或不规范：特许人在申请备案时，未能按照要求提供完整的申请材料，或者提供的材料格式不规范，导致备案申请无法通过。
“两店一年”条件不满足：根据规定，特许人需要拥有至少两家经营一年以上的直营店，这是申请商业特许经营备案的基本条件。如果特许人无法满足这一条件，将无法获得备案。
商标、专利等经营资源问题：特许人在申请备案时，需要提供其拥有的注册商标、专利等经营资源的证明文件。如果这些经营资源存在问题，如商标未注册或已过期，专利无效等，都将影响备案申请的通过。
特许经营合同问题：特许经营合同是备案申请的重要组成部分，如果合同内容不符合法律法规要求，或者合同双方的权利义务不明确，都可能导致备案申请失败。
备案流程不熟悉：部分特许人由于对备案流程不熟悉，导致在申请过程中出现各种错误或遗漏，进而影响备案的顺利进行。
系统操作问题：在提交备案申请时，特许人需要在商务部“商业特许经营信息管理系统”上进行操作。如果特许人对系统操作不熟悉，可能会遇到各种技术问题，如无法登录、信息填写错误等。
为了避免这些问题，特许人在申请商业特许经营备案前，应认真了解备案的相关要求和流程，确保申请材料完整、规范，并提前准备好所有必要的证明文件和合同。也可以咨询专业的法律服务机构或顾问，以获得更准确的指导和帮助。
