商业特许经营备案整体流程如下：
第一步：以备案主体公司名义在商务部官网申请备案登录账号，后续材料都通过这个账号上传至该网站申报；
第二步：准备商业特许经营备案所需的全部材料，根据各地所需材料的差异，该部分内容及相关工作存在较大的区别；
第三步：按要求在商务部官网申报系统上传商业特许经营备案所需材料；
第四步：根据企业所属省/市商务主管部门的审核权限及流程设置，联系对应的审核单位相关部门进行资料审核；
第五步：递交纸质资料；（部分省/市需要）
第六步：在商务部官网进行备案公告。
在实际工作中，第二步的工作内容和工作量因地域差异而存在较大不同，第四步也因各省/市审核流程设置的不同，存在较大差异，且第二步至第四步的工作会因为在审核过程中的退回而不断反复，备案是否通过，以是否在商务部官网进行备案公告为准。同时，备案审核所需时间也因地域等各方面的差异及其他因素的影响而不同，无法准确确定审核的总计时间长度。
