一、做招商加盟但不进行商业特许经营备案存在多方面的危害：
1、这可能导致企业受到商务主管部门的相关处罚。根据相关规定，特许人未按照条例规定向商务主管部门备案的，商务主管部门将责令其限期备案，逾期仍不备案的，将面临5万元以上10万元以下的罚款，并予以公告。
2、不进行商业特许经营备案可能会对特许经营活动产生不利影响。对于已经从事特许经营的特许人来说，如果没有备案，投资人可能会对特许人的招商资格和特许经营能力产生质疑，这会影响企业的信誉和形象。
3、不进行备案还可能增加企业的经营风险，降低诚信度。随着相关单位信息共享机制的建立和完善，不履行备案义务的企业将受到相关行政管理部门、行政执法机关以及司法机关的关注。特别是因不备案而遭受相关处罚后，可能会影响到企业开设分公司的批准或年检注册，会增加败诉的可能性。
4、不进行商业特许经营备案还可能导致企业与加盟商订立的特许经营合同面临无效、被撤销以及解除的风险。如果企业未进行备案就进行非法招商，一旦被发现，可能需要退还加盟商的加盟费和品牌保证金，并可能失去加盟商对企业的信任。
二、商业特许经营备案的法律依据
根据商业特许经营管理条例
第二十四条 特许人不具备本条例第七条第二款规定的条件，从事特许经营活动的，由商务主管部门责令改正，没收违法所得，处10万元以上50万元以下的罚款，并予以公告。
企业以外的其他单位和个人作为特许人从事特许经营活动的，由商务主管部门责令停止非法经营活动，没收违法所得，并处10万元以上50万元以下的罚款。
第二十五条 特许人未依照本条例第八条的规定向商务主管部门备案的，由商务主管部门责令限期备案，处1万元以上5万元以下的罚款;逾期仍不备案的，处5万元以上10万元以下的罚款，并予以公告。
三、进行商业特许经营备案不仅是法律规定的义务，也是企业维护自身权益、降低经营风险、提升信誉的必要措施。建议从事招商加盟的企业务必按照相关规定进行商业特许经营备案。
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