商业特许经营备案的办理材料和流程如下：
所需材料：
1. 特许人的基本情况介绍。
2. 营业执照原件、复印件或其他主体资格证明的原件、复印件。
3. 与特许经营活动相关的商标权、专利权及其它经营资源的注册证书原件及复印件。
4. 特许经营合同样本。
5. 特许经营操作手册。
6. 两家直营店且经营满一年以上的证明文件。
7. 特许经营承诺书。
8. 如有逾期备案的情况，需要提供说明。
9. 如果产品或服务需要经过相关部门批准才能开展特许经营，还需提交相关主管部门的批准文件。
办理流程：
1. 准备以上所述材料，并确保所有材料的真实性和完整性。
2. 登录商务部业务系统统一平台，注册并填写企业信息，然后在线填报《商业特许经营信息报告》。
3. 提交所有准备好的材料，进行在线申报。
4. 商务主管部门会在收到申报后的一段时间内对材料进行审核。
5. 审核通过后，系统内会生成一个专属的备案号，同时商务主管部门会在其商务部网站上公示备案结果。
