京东的自营店与官方旗舰店在运营模式、商品属性、物流配送、售后服务等方面存在一些区别。
在运营模式上，京东自营店是京东公司自己直接经营的店面。商品从品牌厂家进货，储存在京东自己的仓储中心，通过京东平台销售给消费者。而京东官方旗舰店则是各dapinpai商家借助京东平台销售自家产品，这些店铺实际上是由各个商家在运营，商品也储备于商家自己的仓库里面。
在商品属性上，京东自营店像是大型超市，采用统一进货的方式。而旗舰店则像是品牌专卖店，销售的商品更具有品牌特色和定位。
在物流配送方面，京东自营一般使用自己的京东物流，发货快，送货速度也快。而京东官方旗舰店则是由品牌发货，需要先从品牌仓库调货，发货和运输、配送时间较长。
后，在售后服务上，京东自营旗舰店网购的商品由京东提供保障和售后，而官方旗舰店的商品则由该官方旗舰店提供保障和售后。也就是说，在自营旗舰店购买的商品可提供商品官方和京东官方的双重保障，而官方旗舰店则只提供品牌官方的售后服务。
京东自营店与官方旗舰店在运营模式、商品属性、物流配送、售后服务等方面都存在一定的区别，消费者在购物时可以根据自己的需求和喜好选择合适的购买渠道。
