特许加盟许可证的办理流程应该根据主体公司当地的审核政策来，全国的备案都是统一在国家商务部相关网站上进行网报，具体审核是由当地的商务局来具体审核的，我们在哪个地方备案就应该了解哪个地方的政策。各地审核的细节虽有所不同，也有一个大概相同的内容，本次小编主要是针对相同的地方来的，以下主要是根据一帜特许经营备案过去十几年代办经验整理出的详细步骤：
步骤一：确认特许人的申请资格
在申请特许加盟许可证之前，要确认自己是否满足申请资格。特许人应当依法设立的企业或者其他经济组织，拥有有权许可他人使用的商标、商号和经营模式等经营资源，并在中国境内拥有至少两家经营一年以上的直营店或者由其子公司、控股公司建立的直营店。
步骤二：准备特许经营备案的申请材料
申请特许加盟许可证需要提交以下材料：企业法人营业执照副本及复印件、经营场所租赁证明或房产证明、申请书、品牌授权书、品牌介绍及经营模式、申请人身份证明等。
步骤三：提交特许经营备案的申请
准备完成后，需要向市级商务局递交特许加盟许可证申请材料，商务局并对此进行审核。部分地区会由省商务局对申请材料进行在此审查，并在5个工作日内出具受理告知书或不予受理通知书。
步骤四：审核材料与实地考察
省商务委员会对申请材料进行实地考察，调查申请人经营状况、信用记录等情况。市商务局会对直营店的实体店进行实地考察。
步骤五：审批备案与特许经营备案的公示阶段
省商务委员会对申请材料进行审批，决定是否发放特许加盟许可证。审批通过后，省商务委员会发放特许加盟许可证书，申请人领取特许加盟许可证书。
步骤六：特许经营备案
特许人须在自订立首份特许加盟合同之日起15日内，依照相关条例向商务主管部门申请备案。在省级行政单位范围内从事特许加盟活动的，应当向当地的省级相关部门商务主管部门申请备案；跨省从事特许加盟活动的，需要直接向商务主管部门（商务部）申请备案。
以上就是办理特许加盟许可证的主要流程。需要注意的是，不同地区的商务主管部门可能对申请材料有特定要求，企业需要仔细了解并按照要求准备。申请材料必须真实、完整，否则可能导致审核不通过或延误办理时间。
