在商务部申请特许经营备案成功后，备案是有可能会被撤销的。根据《商业特许经营备案管理办法》第十二条的规定，已完成备案的特许人如果存在以下行为之一，备案机关有权撤销其备案，并在商务部网站予以公告：
因特许人违法经营，被主管登记机关吊销营业执照。
备案机关收到司法机关因为特许人违法经营而做出的关于撤销备案的司法建议书。
特许人隐瞒有关信息或者提供虚假信息，且该行为经查证属实。
特许人自行注销。
任何单位或个人如果认为某特许人不再具备备案条件，都有权依据《商业特许经营管理条例》的相关规定，向商务主管部门举报，并申请撤销该特许人的备案。商务主管部门在接到举报后，会依法进行查处。如果经查实，该特许人确实已不具备特许经营备案条件，且未按照相关规定办理备案信息变更或申请撤销商业特许经营备案，那么备案机关也有权撤销其备案。
特许人在获得备案后，需要持续遵守相关法律法规和规定，确保其特许经营活动的合法性和规范性。特许人也应当积极履行其报告义务，如每年一季度将其上一年度订立商业特许经营合同的情况向商务主管部门报告等。
特许经营备案成功后可以为企业带来一定的商业优势和法律保护，但备案并非一劳永逸。特许人需要时刻保持警惕，确保其特许经营活动的合法性和规范性，以避免备案被撤销的风险。
