京东POP店铺和自营店铺在运营模式、经营主体、商品来源、物流服务等方面存在一些区别：
经营主体不同：
自营店铺：由京东公司直接经营，商品由京东采购并负责销售和售后。
POP店铺：由第三方商家经营，商家负责商品的上架、销售和售后服务。
商品来源不同：
自营店铺：商品直接来自品牌厂商或经过京东直接采购。
POP店铺：商品由入驻的第三方商家提供，商家负责商品的供应链管理。
物流服务不同：
自营店铺：通常使用京东自己的物流体系，包括京东快递和京东物流，提供快速的配送服务。
POP店铺：商家可以选择使用京东物流，也可以选择其他物流服务商，物流速度和服务质量可能因商家而异。
售后服务不同：
自营店铺：售后服务通常由京东直接提供，服务标准和流程较为统一。
POP店铺：售后服务由各个商家自行负责，服务标准和流程可能因商家而异。
价格和促销策略不同：
自营店铺：价格和促销活动由京东统一制定，促销活动通常覆盖整个平台。
POP店铺：商家可以根据自己的经营策略制定价格和促销活动，具有更大的灵活性。
品牌曝光和信任度不同：
自营店铺：由于是京东直接经营，消费者可能对自营店铺的商品有更高的信任度。
POP店铺：品牌曝光度和信任度取决于商家自身的品牌建设和服务质量。
入驻门槛和费用不同：
自营店铺：入驻门槛较高，通常需要品牌厂商或大型经销商直接与京东合作。
POP店铺：入驻门槛相对较低，适合中小型商家和新兴品牌入驻。
经营自主性不同：
自营店铺：京东对商品的上架、定价、促销等有较大的控制权。
POP店铺：商家拥有更大的经营自主权，可以根据自己的市场策略进行调整。
自营店铺和POP店铺各有优势，商家可以根据自己的实际情况和经营目标选择合适的模式。