京东旗舰店和京东自营店各有特点，新手可从以下几个方面考虑如何选择：
从自身资源和能力角度
品牌影响力
京东旗舰店：适合已有一定品牌度和粉丝基础的新手，可通过旗舰店强化品牌形象，直接与消费者互动，传递品牌价值。
京东自营店：适合有借助京东品牌提升自身品牌认知度的新手。像一些或大型国内品牌，入驻京东自营能借助平台流量快速打开市场。
资金实力
京东旗舰店：保证金一般在 5 万 - 20 万，资金压力相对较小。
京东自营店：保证金一般在 10 万 - 50 万，需要提前备货，对资金流要求较高。
供应链稳定性
京东旗舰店：库存管理相对灵活，可根据销售情况随时调整进货量。
京东自营店：要求商家具备强大的供应链管理能力，能稳定、及时地供货。
运营能力与团队
京东旗舰店：需自行负责店铺运营的各个环节，包括商品上架、营销推广、客服售后等，适合有一定电商运营经验和团队的新手。
京东自营店：京东负责主要的运营工作，商家配合即可，适合不想过多参与日常运营，希望专注于产品生产和供应的新手。
从店铺特点和优势角度
流量与曝光
京东旗舰店：流量相对自营店少，需通过京东快车、京挑客等工具主动推广引流。
京东自营店：京东会给予大量流量倾斜，在搜索结果中通常排名靠前，曝光机会更多。
商品控制权
京东旗舰店：商家自主定价、自主决定商品展示和营销方式，能更好地体现品牌特色和产品定位。
京东自营店：商品定价权在京东手中，可能会根据市场情况和促销活动进行调整。
售后服务
京东旗舰店：由品牌方或代理商负责售后服务，可能会因品牌不同而存在服务水平差异。
京东自营店：京东统一提供售后服务，有完善的售后体系，消费者认可度高。